Дана 27. јануара 2014. године, око 10,30 сати, у североисточном крилу зграде Краљевог конака у комплексу манастира Прохора Пчињског избио је пожар.

Увидом у стање, које су 28. јануара обавили в.д. директора Мирјана Андрић, архитекта Драгољуб Тодоровић и историчар уметности Светлана Пејић, констатовано је да је пожар избио у североисточном крилу зграде и најпре захватио његову кровну конструкцију. Урушавање кровних греда изазвало је пожар међуспратне дрвене конструкције, која је у потпуности страдала, при чему је изгорео и дрворезбарени иконостасни крст с почетка 17. века.

Пожар се брзо проширио, захвативши недавно обновљени кров западног тракта зграде Краљевог конака. Кров је у потпуности изгорео, а делимично је страдала и његова међуспратна конструкција.

Пошто још увек сагоревају дрвени елементи конструкције и просторије су затрпане шутом, након стабилизације стања и рашчишћавања у манастир ће бити упућена комисија која би проценила како статичку стабилност преосталих зидова, тако и насталу штету.